Prezídium je volený orgán, ktorý sa skladá z členov ASSR, ktorých do prezídia volí republiková konferencia. Z jej členov sa volí prezident a generálny sekretár.

Prezídium zabezpečuje činnosť ASSR v období medzi republikovými konferenciami.

Prezídium zvoláva generálny sekretár podľa potreby, najmenej však 6 krát ročne.

Prezídium predovšetkým:

• Vydáva a ruší licencie okresným ASSR podľa licenčného poriadku ASSR.
• Rokuje v mene ASSR.
• Rozhoduje o uvoľňovaní finančných prostriedkov na činnosť AS SR, podľa interných predpisov AS SR.
• Zriaďuje organizačné jednotky, vydáva a schvaľuje ich stanovy, zriaďovacie alebo zakladacie listiny, menuje a odvoláva ich štatutárnych zástupcov.
• Zriaďuje pracovné komisie alebo pracovné skupiny, ktoré majú poradnú a iniciačnú funkciu.
• Udeľuje čestné členstvo v ASSR.

Súčasné zloženie Prezídia ASSR:

1. MUDr. Marcel Sedlačko – prezident
2. Mgr. Renáta Zichová – generálny sekretár
3. MUDr. Ján Jedinák – člen
4. MUDr. Marián Maďar – člen